Введение в микроскопы и принципы их работы. Охватывает светлопольную микроскопию, флуоресцентную микроскопию и электронную микроскопию.
Вступление
Если вы встретите некоторых клеточных биологов и заставите их рассказать о том, что им больше всего нравится в своей работе, вы можете обнаружить, что все сводится к одному: втайне они все помешаны на микроскопии. В конце концов, что им действительно нравится, так это возможность часами сидеть в маленькой темной комнате, общаясь со своим любимым типом клеток через линзу красивого микроскопа. Это может показаться странным, но на самом деле клетки могут быть довольно красивыми, как живые витражи. Один из моих любимых примеров - картинка ниже, на которой показаны клетки очень молодого листа кресс-салата, небольшого цветущего растения, связанного с горчицей.
Микроскопы и линзы
Хотя клетки различаются по размеру, обычно они довольно маленькие. Например, диаметр типичного человеческого эритроцита составляет около восьми микрометров (0,008 миллиметра). Чтобы дать вам некоторый контекст, головка булавки имеет диаметр около одного миллиметра, поэтому около 125 красных кровяных телец могут быть выстроены в ряд на головке булавки. За некоторыми исключениями, отдельные клетки нельзя увидеть невооруженным глазом, поэтому ученые вместо этого должны использовать микроскопы ( микро - = «маленький»; - scope = «смотреть на») для их изучения. Микроскоп является инструментом , который в противном случае объектов усиливающих слишком малы , чтобы быть видны, создавая изображение , в котором объект кажется больше. Большинство фотографий клеток делается с помощью микроскопа, и эти снимки также можно назвать микрофотографиями..
Из приведенного выше определения может показаться, что микроскоп - это просто увеличительное стекло. Фактически, лупы действительно можно отнести к микроскопам; поскольку у них всего одна линза, они называются простыми микроскопами . Более изящные инструменты, которые мы обычно называем микроскопами, представляют собой составные микроскопы , что означает, что они имеют несколько линз. Из-за того, как эти линзы расположены, они могут преломлять свет, создавая гораздо более увеличенное изображение, чем у увеличительного стекла.
- Увеличение - это мера того, насколько крупный микроскоп (или набор линз в микроскопе) вызывает появление объекта. Например, световые микроскопы, обычно используемые в средних школах и колледжах, увеличивают примерно в 400 раз. Итак, что-то, что в реальной жизни было шириной 1 мм, на изображении с микроскопа будет иметь ширину 400 мм.
- Разрешение микроскопа или линзы это наименьшее расстояние , по которому две точки могут быть разделены и по- прежнему быть выделены в качестве отдельных объектов. Чем меньше это значение, тем выше разрешающая способность микроскопа и лучше четкость и детализация изображения. Если бы две бактериальные клетки были очень близко друг к другу на предметном стекле, они могли бы выглядеть как одна размытая точка на микроскопе с низкой разрешающей способностью, но их можно было бы различить как отдельные на микроскопе с высокой разрешающей способностью.
И увеличение, и разрешение важны, если вы хотите получить четкое изображение чего-то очень маленького. Например, если у микроскопа большое увеличение, но низкое разрешение, все, что вы получите, - это увеличенная версия размытого изображения. Различные типы микроскопов различаются увеличением и разрешением.
Световые микроскопы
Большинство студенческих микроскопов классифицируются как световые микроскопы . В световом микроскопе видимый свет проходит через образец (биологический образец, на который вы смотрите) и изгибается через систему линз, позволяя пользователю видеть увеличенное изображение. Преимущество световой микроскопии заключается в том, что ее часто можно проводить на живых клетках, поэтому можно наблюдать под микроскопом клетки, выполняющие свое нормальное поведение (например, миграцию или деление.
Студенческие лабораторные микроскопы, как правило, являются светлопольными микроскопами, что означает, что видимый свет проходит через образец и используется для формирования изображения напрямую, без каких-либо модификаций. Немного более сложные формы световой микроскопии используют оптические приемы для увеличения контраста, что позволяет легче увидеть детали клеток и тканей.
Другой тип световой микроскопии - флуоресцентная микроскопия , которая используется для изображения образцов, которые флуоресцируют (поглощают одну длину волны света и излучают другую). Свет одной длины волны используется для возбуждения флуоресцентных молекул, а излучаемый ими свет другой длины волны собирается и используется для формирования изображения. В большинстве случаев часть клетки или ткани, на которую мы хотим смотреть, не имеет естественной флуоресценции, и вместо этого ее необходимо пометить флуоресцентным красителем или меткой, прежде чем она попадет в микроскоп.
Изображение листа в начале статьи было получено с помощью специальной флуоресцентной микроскопии, называемой конфокальной микроскопией . Конфокальный микроскоп использует лазер для возбуждения тонкого слоя образца и собирает только излучаемый свет, исходящий от целевого слоя, создавая резкое изображение без помех от флуоресцентных молекул в окружающих слоях.
Электронные микроскопы
Некоторые передовые типы световой микроскопии (помимо методов, которые мы обсуждали выше) могут создавать изображения с очень высоким разрешением. Однако, если вы хотите увидеть что-то очень маленькое при очень высоком разрешении, вы можете использовать другой проверенный метод: электронную микроскопию.
Электронные микроскопы отличаются от световых микроскопов тем, что они создают изображение образца с помощью пучка электронов, а не пучка света. Электроны имеют гораздо более короткую длину волны, чем видимый свет, и это позволяет электронным микроскопам получать изображения с более высоким разрешением, чем стандартные световые микроскопы. Электронные микроскопы можно использовать для исследования не только целых клеток, но и субклеточных структур и компартментов внутри них.
Однако одним ограничением является то, что образцы для электронной микроскопии должны быть помещены в вакуум в электронной микроскопии (и обычно готовятся с помощью обширного процесса фиксации). Это означает, что живые клетки не могут быть отображены.
На изображении выше вы можете сравнить, как бактерии сальмонеллы выглядят на световой микрофотографии (слева) с изображением, полученным с помощью электронного микроскопа (справа). Бактерии проявляются в виде крошечных пурпурных точек на изображении светового микроскопа, тогда как на электронной микрофотографии вы можете ясно увидеть их форму и текстуру поверхности, а также детали человеческих клеток, в которые они пытаются вторгнуться.
Существует два основных типа электронной микроскопии. В сканирующей электронной микроскопии (SEM) пучок электронов движется вперед и назад по поверхности клетки или ткани, создавая подробное изображение трехмерной поверхности. Этот тип микроскопии был использован для получения изображения бактерий Salmonella, показанных справа вверху.
В просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ), в отличие от этого , образец разрезают на очень тонкие ломтики (например, с помощью алмазного режущей кромки) до обработки изображений, и электронный пучок проходит через срез , а не скользя по его поверхности^ 55начальный надстрочный индекс, 5, конечный надстрочный индекс. ПЭМ часто используется для получения подробных изображений внутренней структуры клеток.
Электронные микроскопы, подобные приведенному выше, значительно крупнее и дороже стандартных световых микроскопов, что неудивительно, учитывая субатомные частицы, с которыми им приходится работать!
Факторы, которые следует учитывать при выборе исследовательского микроскопа
Какой исследовательский микроскоп мне подойдет? В этой статье дается краткий обзор основных характеристик, которые следует учитывать при выборе оптического исследовательского микроскопа.
Оптический микроскоп часто является одним из центральных устройств научно-исследовательской лаборатории. Его можно использовать для различных приложений, которые проливают свет на многие научные вопросы. Таким образом, конфигурация и характеристики микроскопа имеют решающее значение для области применения, начиная от светлопольной и флуоресцентной микроскопии и заканчивая визуализацией живых клеток.
В этой статье дается краткий обзор соответствующих функций микроскопа и освещаются ключевые вопросы, которые следует учитывать при выборе исследовательского микроскопа.
Какой образец вы используете?
При выборе исследовательского микроскопа в первую очередь следует учитывать тип образца, который вы хотите исследовать. Для фиксированных образцов, помещенных на тонкое предметное стекло, можно использовать вертикальный микроскоп. Живые клетки требуют особых характеристик микроскопа, потому что они хранятся в относительно больших сосудах для культивирования клеток, заполненных средой для культивирования клеток.
Только перевернутая конфигурация с объективом внизу и конденсатором над образцом обеспечивает необходимое свободное пространство и необходимую близость объектива к образцу. В то же время инвертированный микроскоп сохраняет хороший доступ к клеткам, например, для добавления микроманипуляторов.
Кроме того, живым клеткам для выживания требуется соответствующая среда. Температура и концентрация CO 2 должны поддерживаться на определенных уровнях. Для выполнения этой задачи необходима климатическая камера с соответствующими контроллерами.
Как вы думаете, в каких измерениях?
Микроскопический образец разложен по трем параметрам: длина, ширина и высота. В то время как некоторые образцы, такие как гистологические срезы, отображаются только в xy-направлении, есть другие приложения, требующие получения также и в z-измерении. Для получения трехмерных изображений, например, живых клеток, рекомендуется револьвер с моторизованным объективом, который может пошагово направлять образец через фокус. Программное обеспечение для визуализации должно иметь возможность реконструировать отдельные изображения для трехмерной визуализации.
Для живых клеток необходимо добавить время измерения. В этом случае, например, стабильность системы - еще одна важная особенность. Поскольку изменения температуры влияют на систему визуализации во время съемки, необходимы эффективные меры противодействия. Автоматическая регулировка фокуса, такая как Adaptive Focus Control ( AFC ), противодействует этим тепловым воздействиям и всегда находит заранее заданный фокус.
Какой метод контраста лучше всего подходит для вашего образца?
Большинство клеток, особенно клеток животных, исследованных под микроскопом, не обладают достаточным внутренним контрастом, чтобы разглядеть мелкие детали. Исследователи используют контрастные методы, чтобы решить эту проблему. В то время как фазовый контраст (PH) и дифференциальный интерференционный контраст ( DIC ) манипулируют светом, проходящим через образец, чтобы добавить контраст, вы также можете окрашивать его флуоресцентными красителями ( иммунофлуоресценция ), соответственно, используя флуоресцентные белки .
В зависимости от метода контраста микроскоп требует специального оборудования; например, для фазового контраста требуются специальные объективы, тогда как в ДИК используются определенные призмы, которые необходимо переключить на световой путь. Для флуоресцентной микроскопии вам понадобятся специальные кубы с фильтрами, позволяющие свету правильной длины получать доступ к образцу и выходить из него.
А как насчет источника света?
Выбор метода контраста также определяет источник света. Освещение в проходящем свете для обычной светлопольной микроскопии, фазового контраста и ДИК может осуществляться с помощью галогенного или светодиодного освещения. Флуоресцентная микроскопия может выполняться как при светодиодном освещении, так и с помощью ртутных , ксеноновых или ртутных металлогалогенных ламп.
Вы хотите задокументировать или опубликовать свои результаты?
Если вы хотите сделать снимок своего образца или визуализировать живые клетки, вам понадобится камера цифрового микроскопа . Особенно в случае флуоресцентной визуализации живых клеток рекомендуется использовать чувствительную камеру, чтобы свести к минимуму количество возбуждающего света, который может повредить клетки. В дополнение к хорошо зарекомендовавшим себя камерам CCD и EMDDC , в настоящее время используются камеры sCMOS благодаря их высокой квантовой эффективности и скорости сбора данных. Для получения дополнительной информации о камерах цифровых микроскопов прочтите статью Введение в технологию цифровых камер.
Кроме того, большое поле зрения (FOV) помогает быстрее находить интересные области и одновременно отображать большее количество ячеек. Современные исследовательские микроскопы имеют 19-миллиметровый FOV на порте камеры, который идеально соответствует 19-миллиметровому чипу камеры sCMOS.Вам нужна (3D) информация из толстых образцов?
олстые образцы представляют собой серьезную проблему для микроскопии. Особенно в широкоугольной микроскопии , когда весь образец освещается одновременно, идентификация деталей образца, которые находятся в фокусе, может быть значительно снижена за счет дополнительного света, исходящего из областей вне фокуса.
Вычислительная очистка может помочь получить изображения без не в фокусе света. Этот метод может быть применен либо к одной плоскости изображения для мгновенных результатов (ICC: мгновенная вычислительная очистка), либо может быть объединен с дополнительным этапом деконволюции (SVCC: вычислительная очистка малых объемов; LVCC: вычислительная очистка больших объемов) для еще лучших результатов. . Деконволюция переназначает информацию о фотонах на их источник и, таким образом, дает лучший контраст желаемых структур в фокальной плоскости. Это может позволить пользователям легче отличать интересующие структуры от фона, чем при использовании традиционных широкоугольных изображений.
Вы хотите манипулировать своими клетками под микроскопом?
В последние годы стало популярным фото-манипуляция с экземпляром. Это означает, что исследователи не только наблюдают за живыми клетками, но и манипулируют ими с помощью света. Восстановление флуоресценции после фотообесцвечивания ( FRAP ) - один из примеров, который помогает распутать динамические клеточные процессы. Для такого рода манипуляций часто требуются дополнительные источники света, которые необходимо интегрировать в световой тракт микроскопа.
Это нетривиальный подход. Leica Infinity Port - это универсальное решение, которое позволяет подключать дополнительные источники света к световому тракту микроскопа без нарушения качества изображения, например, для FRAP , фотопереключения, абляции или оптогенетики. Имея под рукой подходящий адаптер, исследователи могут даже соединить свои самодельные устройства.
Каков твой бюджет?
Один важный вопрос - сколько денег вы можете потратить. Некоторые поставщики микроскопов предлагают заранее определенные конфигурации, которые подходят для специальных приложений. Но что, если вам не нужны все предварительно настроенные компоненты, за которые вы платите? Вот почему бесплатная конфигурация компонентов может быть дешевле, чем покупка готовой системы микроскопа.
Кроме того, со временем требования к микроскопу могут измениться. В этом случае обновляемая система имеет определенные преимущества. С предопределенной и фиксированной конфигурацией вы можете быть привязаны к ограниченному количеству приложений. Возможность обновления дает вам свободу роста в соответствии с меняющимися требованиями.
Принимая во внимание эти моменты, модульная платформа микроскопии , такая как Leica DMi8 , позволяет исследователю начать с доступной системы микроскопа, которую можно модернизировать позже и расширять в соответствии с его требованиями.
Кто будет пользоваться микроскопом?
Круг пользователей микроскопов может быть очень неоднородным. Пользователи, особенно в университете, могут быть как очень опытными, так и новичками. Таким образом, простая в использовании система микроскопа, управляемая интуитивно понятным программным обеспечением , таким как Leica Application Suite X ( LAS X ), помогает быстро начать работу и быстро собирать данные. Например, дизайн, ориентированный на рабочий процесс, мастера анализа изображений и бесшовная интеграция периферийных устройств в систему упрощают вашу работу.